Jean MOULIN est nommé délégué du Comité National par le Général de GAULLE lui-même.
Dans une première période il prend contact avec les chefs des mouvements de Résistance.
Au cours d'une 2^ème période (vers la mi-1942), il regroupe les effectifs paramilitaires des mouvements dans l’A.S. (Armée Secrète) et Général DELESTRAINT en devient le chef.

Il organise ensuite d’autres services comme celui des transmissions en octobre 1942 le WT, puis le SOAM (Services des Opérations Aériennes et Maritimes), le BIP pour la propagande, le CGE (Comité Général des Etudes : c'est un comité d’experts).
Pour coordonner tous ces services, Jean MOULIN se dote d’un secrétariat général qu’il confie à Daniel CORDIER.